截止2019年末全区拥有卫生医疗机构188家。其中，综合医院12家，社区卫服务中心（卫生院）8家，社区卫生服务站（村卫生室）40家，护理院6家。卫生技术人才4234人。其中，医师1377人，护士1393人，卫生技术人员1464人。全区共有医疗床位3043张。

　　2020年6月2日，新吴区入选第五批国家慢性病综合防控示范区。